種子加工是種子物料在場上作業(yè)，凈度達(dá)到90%以上之后，向著更高商品化的進(jìn)一步深加工。其中清除種子物料中的各種雜質(zhì)是種子加工實(shí)現(xiàn)商品化的首要環(huán)節(jié)。一般參考如下原則。
　　
　　1、清除比好種子在重量上明顯輕，且尺寸大小和好種子有明顯差別的，應(yīng)風(fēng)篩式清選機(jī)械。該機(jī)械目前使用zui普遍。
　　
　　2、清除在長短尺寸上有明顯差別，且經(jīng)過風(fēng)篩選加工后仍有不能清除的長雜或短雜時(shí)，應(yīng)當(dāng)試選窩眼式清選機(jī)。
　　
　　3、經(jīng)過風(fēng)篩式清選機(jī)和窩眼式清選機(jī)加工后，凈度已經(jīng)明顯提高，且粒度比較均勻，但仍有一些諸如玉米中的干癟粒、蟲蛀粒、穗腐病粒；小麥中的干癟粒、蟲吸粒，帶殼粒；水稻中的干癟粒、黑粉病粒、芽谷粒；豆類中的蟲蛀粒、病粒、皺皮粒……以上雜質(zhì)多屬密度（比重）雜質(zhì)，在重量上往往與好種子相近，甚至重于好種子，非用比重式清選機(jī)械不能清除。比重式清選機(jī)械隨著種業(yè)的發(fā)展日趨普及，操作難度大于風(fēng)篩式清選機(jī)械。
　　
　　當(dāng)然在進(jìn)行清選前有的種子還需要脫粒、取籽、除芒、脫絨、磨光、去石，那還要選購相應(yīng)的機(jī)械進(jìn)行加工。如玉米種子從果穗開始加工，應(yīng)選脫粒清選機(jī)械；水稻需要除去稻芒，應(yīng)選用除芒機(jī)。
　　
　　如果種子已經(jīng)清選達(dá)標(biāo)，還需進(jìn)行深加工，如拌藥、包衣、丸粒化，還有計(jì)量、包裝，均需要選購相應(yīng)的機(jī)械。
　　
　　種子加工機(jī)械不但功能不同，種類繁多，而且在具體使用上也有檔次之分。
　　
　　檔次，用大型成套設(shè)備，俗稱流水線，氣派且投資大，適應(yīng)大規(guī)模生產(chǎn)經(jīng)營，現(xiàn)代化水平高，加工效果自然好。
　　
　　一般初級(jí)檔次僅用單機(jī)，只能清除某一種雜質(zhì)，難以一次加工達(dá)標(biāo)。
　　
　　中級(jí)檔次為種子加工配套機(jī)組，就目前而言適應(yīng)當(dāng)今中國種業(yè)崛起的生產(chǎn)力水平和生產(chǎn)經(jīng)營模式，具有投資少，見效快，操作簡捷，移動(dòng)方便，堅(jiān)實(shí)耐用，回報(bào)率高的優(yōu)勢，較受種業(yè)界的歡迎。