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更新時間:2021-02-05 15:53:57瀏覽次數(shù):297次
聯(lián)系我時,請告知來自 農(nóng)機(jī)網(wǎng)PhenoTron ®作物種質(zhì)資源監(jiān)測鑒定平臺
SpectraScan-R根系光譜掃描成像分析系統(tǒng)
WinCELL是一種特別設(shè)計用來分析樹木細(xì)胞的圖像分析系統(tǒng) 它可以量化年輪上樹木結(jié)構(gòu)的變化。
解剖學(xué)樹木細(xì)胞分析可用X射線進(jìn)行樹木密度分析(例如WinDENDRO)。木材密度、色彩、機(jī)械和化學(xué)性質(zhì)都受到樹木樹輪結(jié)構(gòu)的影響,而該結(jié)構(gòu)又與環(huán)境氣候有關(guān)。通過測量輻射細(xì)胞(管胞)的尺寸、分布以及到內(nèi)壁的比例,木材的質(zhì)量可以評估出來。
WinCELL使用顯微鏡用薄片切片機(jī)產(chǎn)生的木材樣品切片,或者,對于如同落葉類植物春材導(dǎo)管這類大細(xì)胞,可直接從木材表面*獲得樣品來測量樹木細(xì)胞的形態(tài)。樹木細(xì)胞的形態(tài)數(shù)據(jù)可以使用數(shù)據(jù)快速處理和可視化的伴侶軟件XLCell來對每個輪圈的1個或多個圖像上的每個年輪進(jìn)行測量。
一般圖像分析者不會特地對樹木細(xì)胞進(jìn)行測量,通常測量所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)都不適合于樹木年代學(xué)研究。這些系統(tǒng)都缺乏關(guān)于樹木年輪形成及其細(xì)胞結(jié)構(gòu)(例如計算樹輪寬度)的知識,因此它們都不知道在這個領(lǐng)域如何進(jìn)行測量。WinCELL則知道如何去做,例如兩個相鄰細(xì)胞間的細(xì)胞壁必須一分為二來計算細(xì)胞的長度和春材或樹輪寬度,其通用設(shè)置可以用來分析不同類型的樹木(落葉類植物導(dǎo)管和針葉類管胞的放射狀排列)。它支持全自動和交互式分析模式,后者允許用戶選擇細(xì)胞行列以模擬傳統(tǒng)管胞**的方法進(jìn)行分析。WinCELL可以處理不完整的細(xì)胞,它們會被圖像邊界刪除,因此不會對平均的細(xì)胞測量產(chǎn)生影響。
*使用適當(dāng)?shù)膱D像捕獲裝置和 樣品制備。
**年輪中不同功能位置的放射細(xì)胞尺寸的曲線圖表。
圖像捕獲
近年來發(fā)展出的高質(zhì)量數(shù)碼相機(jī)使解剖學(xué)樹木細(xì)胞分析較以往更容易實現(xiàn)。
樣品制備
木材細(xì)胞分析通常通過顯微鏡用薄片切片機(jī)產(chǎn)生的木材樣品切片來進(jìn)行。有時通過染色來提高內(nèi)腔的對比度。在適當(dāng)?shù)臏?zhǔn)備和照明下,大的導(dǎo)管可從木材表面進(jìn)行直接分析。
顯微鏡
為了獲取顯微鏡用薄片切片機(jī)產(chǎn)生的木材樣品切片的圖像,需要有帶有可以安裝相機(jī)的附件插管和C-安放適配器(由顯微鏡制造商提供)的顯微鏡。
相機(jī)
WinCELL 可以分析由數(shù)碼相機(jī)或模擬相機(jī)捕獲的圖像。由Regent銷售的型號都是科研等級并且都有可以安裝在顯微鏡上的標(biāo)準(zhǔn)C-安放螺紋。 我們銷售從1到6兆像素(百萬像素)的三種型號的相機(jī),這些相機(jī)可以直接安裝在木片上方(帶有光學(xué)透鏡)。樣品表面被很好地制備,WinCELL也可以從光學(xué)掃描儀獲取圖像(選購前請查詢條件)來分析大細(xì)胞(導(dǎo)管) 。由Regent 銷售的相機(jī)可以通過“火線"(IEEE-1394)或USB2.0 接口連接到計算機(jī)上。WinCELL是TWAIN兼容產(chǎn)品,這意味著它可以從很多種相機(jī)和掃描儀獲取圖像。
從WinCELL獲取的圖像
當(dāng)用戶調(diào)整顯微鏡或樣品位置時,簡單地點(diǎn)擊WinCELL 軟件窗口中的圖標(biāo)就可以在計算機(jī)的顯示屏上實時顯示圖像(或半實時顯示圖像,依據(jù)相機(jī)類型)。當(dāng)圖像顯示后,用戶也可以設(shè)置圖像參數(shù)(尺寸、色彩、過濾器)。要數(shù)字化和分析圖像,只須簡單地點(diǎn)擊相機(jī)界面窗口中的按鈕。
WinCELL全系統(tǒng)組成:
Y 帶有彩色說明書的WinCELL 標(biāo)準(zhǔn)或加強(qiáng)版軟件。
Y 灰度或彩色“火線"或USB 2.0相機(jī),分辨率3或5百萬像素,2米連接纜線。
Y 數(shù)據(jù)分析和可視化XLCell 伴侶軟件。
Y 產(chǎn)品終止后長2年免費(fèi)。
Y 系統(tǒng)不包括: 相機(jī)用C-安放適配器,這些適配器應(yīng)該由顯微鏡廠商提供; 相機(jī)鏡頭(在顯微鏡上的相機(jī)無須鏡頭,但不使用顯微鏡而做其它應(yīng)用時需要鏡頭)。
WinCELL相機(jī)和可選件:
Y 數(shù)字“火線"相機(jī),分辨率3或5百萬像素,2米連接纜線。
Y “火線"卡,安裝在無“火線"連接器的PC的PCI插槽上
可選:
Y “火線"纜線5米。
Y 大鏡頭,可用于諸如葉面積測量等其它應(yīng)用。
WinCELL測量
可通過不同的方式進(jìn)行細(xì)胞形態(tài)學(xué)測量:自動、半自動或手動(交互式)
分析區(qū)域
分析樣品的*步是選擇分析區(qū)域。所有的版本僅能分析整體圖像,而加強(qiáng)版可以對任何形狀的區(qū)域進(jìn)行分析。在右圖的示例中,創(chuàng)建了分析區(qū)域(綠線內(nèi)部分)僅對屬于特定年輪的春材導(dǎo)管進(jìn)行分析。這些區(qū)域可以很容易地通過在圖像上描畫輪廓來選定。指令可以快速、容易地創(chuàng)建矩形和圓形的分析區(qū)域。
內(nèi)腔和外壁面積
內(nèi)腔面積自動測量并且是真實測量面積(基于其內(nèi)包含的像素數(shù)量)而并非由直徑估算。內(nèi)腔基于它們的面積可以被分成細(xì)胞和導(dǎo)管群,那些大于值的被歸類到導(dǎo)管,小于值的被歸類到細(xì)胞,兩個族群可以分別分析(可以獲得兩者總體和個體的數(shù)據(jù))。用戶可以簡單地通過按鍵和點(diǎn)擊目標(biāo)來進(jìn)行重新分級。外壁面積通過計算分析區(qū)域中屬于外壁的像素等級面積來自動計算。
內(nèi)腔和外壁面積用于被分析區(qū)域的總值(測量單位和被分析區(qū)域面積的百分比),內(nèi)腔面積還作為基于單獨(dú)分析數(shù)據(jù)中的單另細(xì)胞或?qū)Ч堋?/span>
內(nèi)腔面積色彩功能
除去細(xì)胞和外壁面積以外,加強(qiáng)版還可以利用色彩功能測量整個分析區(qū)域或部分區(qū)域(每個細(xì)胞)的內(nèi)腔和外壁面積。
管胞長度和寬度
管胞長度和寬度(或徑向和縱向直徑)可以用不同的方式進(jìn)行計算。
大長度和寬度 | 縱向和徑向直徑 |
大長度和寬度:
用該方法計算的管胞長度是細(xì)胞內(nèi)腔邊界中遠(yuǎn)兩點(diǎn)間的距離。它是在任意方向上測量過的大細(xì)胞長度。寬度是在與長度垂直方向上的長距離。
縱向和徑向直徑:
長度是直接徑向測量,寬度是直接縱向測量(反之亦然)。該方法提供三種變化模式(它們的區(qū)別在于位置和測量的長度)。
管胞長度和寬度既可以是整個測量區(qū)域內(nèi)的平均值,也可以是單獨(dú)細(xì)胞或?qū)Ч艿闹怠?/span>
細(xì)胞位置
在圖像上,細(xì)胞的中心位置可以被測量,該位置與年輪起始有關(guān)。后者可以用來對年輪上功能位置的細(xì)胞結(jié)構(gòu)參數(shù)分布進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)計算。
管胞數(shù)量(細(xì)胞和導(dǎo)管)
在被分析區(qū)域或在跡線路徑中的細(xì)胞和導(dǎo)管可以被自動計數(shù)。
自動與交互式測量方式
上面提及的形態(tài)學(xué)測量,在整個分析區(qū)域或通過交互式測量選定的細(xì)胞,都可以自動進(jìn)行計算。在自動模式,用戶所要做的事情只是點(diǎn)擊圖像或指示出分析區(qū)域和被分析區(qū)域中包含的細(xì)胞。在交互式方式,用戶簡單地畫一條穿過細(xì)胞的線來測量。后者通常用來分析徑向細(xì)胞行列(與年輪邊界位置相關(guān)的細(xì)胞排列是*的)。
交互式測量模式有4種設(shè)置
在*手動模式中,不會自動對圖像進(jìn)行分析。此模式被用于測量任何用手簡單地在末端點(diǎn)擊的對象。它可以用來測量細(xì)胞長度或用來對完整的纖維長度進(jìn)行闡述。平直的對象可以通過在其末端點(diǎn)擊兩次進(jìn)行測量,彎曲的對象可以通過在其曲率的變形點(diǎn)上額外點(diǎn)擊鼠標(biāo)進(jìn)行測量。另外的手動模式用來成對測量對象的長度和寬度(可在之后估算面積),還可以在對比度達(dá)不到自動分析要求時對細(xì)胞進(jìn)行測量。
兩種半自動測量模式可以用來測量細(xì)胞長度和它們相鄰的兩個壁厚(在內(nèi)腔的對側(cè))。一種模式在跡線方向上進(jìn)行,另一種模式在放射狀方向上進(jìn)行。
這兩種半自動測量方法也可以得出放射狀細(xì)胞行列的長度(介于年輪分界線和輪寬度之間)。
WinCELL 特點(diǎn) | |
加強(qiáng)版: 可以分析任何形狀的區(qū)域。矩形和圓形區(qū)域可以預(yù)定義,用戶還可以使用套索工具創(chuàng)建任意無規(guī)律的形狀。當(dāng)創(chuàng)建好區(qū)域后,可以調(diào)整大小,分析結(jié)果也會相應(yīng)地自動調(diào)整。
區(qū)域可以用來分析圖像中分離的不同的部分(如同右側(cè)的春材)。 | |
WinCELL 使用分析區(qū)域的概念是為了屏棄不完整的細(xì)胞。接近圖像邊緣或在分析區(qū)域以外的細(xì)胞在進(jìn)行細(xì)胞平均測量計算(面積、長度和寬度)時可以不予考慮。 顏色可以用于細(xì)胞指示其分級(被圖像邊緣切割、部分或*在分析區(qū)域內(nèi)外、操作者遺棄、碎片、介于細(xì)胞或?qū)Ч荛g的細(xì)胞類型)。 | |
在測量期間測量數(shù)據(jù)是交互式的,文本格式的文件可以被許多程序軟件讀取。這些文件可以很容易地被諸如Microsoft Excel的電子表格程序打開。用戶也可以點(diǎn)擊一個細(xì)胞來顯示其形態(tài)學(xué)測量數(shù)據(jù)。細(xì)胞分布的柱狀圖可以在分析期間或在XLCell程序處理后看到,它也可以表現(xiàn)細(xì)胞結(jié)構(gòu)參數(shù)的整體觀。 | 細(xì)胞分布柱狀圖顯示了不同面積、長度、寬度細(xì)胞的數(shù)量。對加強(qiáng)版為顏色功能面積。 |
圖像編輯可以補(bǔ)償缺陷或差對比度(例如夏材細(xì)胞的內(nèi)腔經(jīng)常是暗黑的) | 圖像可以用任何顏色編輯??梢匀菀椎剡x擇圖像中表現(xiàn)的顏色并用它編輯。通??梢允褂霉ぞ吖P(用來畫線)和工具索套(用來確定區(qū)域輪廓)進(jìn)行編輯。 |
加強(qiáng)版:缺陷或不希望被分析的區(qū)域可以用排除區(qū)域或編輯圖像來排除,排除區(qū)域可以是任何形狀。 | |
WinCELL可以分析灰度或彩色圖像(我們的相機(jī)這兩種圖像都可以產(chǎn)生)。加強(qiáng)版在彩色圖像上可以做更多的分析。 它可以顯示和分析彩色圖像的三中色彩通道之一,使用色彩來更好地在內(nèi)腔和外壁或色彩量化區(qū)域?qū)ο袼剡M(jìn)行分類。 | |
內(nèi)建校驗程序并可很容易地用顯微鏡廠商的目標(biāo)來執(zhí)行,支持不同的目標(biāo)模式。 | |
碎片可以自動地由尺寸過濾,或通過編輯圖像手動處理。 | |
由WinCELL獲取的原始圖像,無論是否經(jīng)過分析,都可以存儲成標(biāo)準(zhǔn)的tiff 或bmp 文件,這些文件可用于其它應(yīng)用程序(MS Word, Photoshop等)。 | |
批處理可以分析一系列圖像而無須操作人員監(jiān)督。這中分析方式僅能以自動模式進(jìn)行(非交互式)。 | |
可以在配置文件中存儲分析設(shè)置,在后續(xù)操作或重復(fù)操作中使用。 | |
用戶可以選擇存儲的數(shù)據(jù)類型。 | |
WinCELL也可以做為通常的面積儀使用(例如測量葉面積),更改一些默認(rèn)設(shè)置后,也可以作為其它物體的形態(tài)學(xué)分析設(shè)備來使用。 | |
當(dāng)購買WinDENDRO系統(tǒng)時, WinCELL標(biāo)準(zhǔn)版軟件是免費(fèi)附贈的。 | |
WinCELL會規(guī)律升級。 |
產(chǎn)地:加拿大
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